152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1638 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1638  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  280  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170116  normal  0.0161914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  38.17 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2957  UspA domain protein  37.41 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0210992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.44 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  40.88 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  38.13 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  34.48 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  36.23 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.14 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  37.06 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 300 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  35.71 
 
 		 324 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  31.94 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.56 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  35.56 
 
 		 293 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.33 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.56 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  30.56 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.8 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  33.58 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.65 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.88 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.89 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.56 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  38.89 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.61 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  34.97 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  32.17 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.37 
 
 		 308 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 293 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2140  hypothetical protein  36.05 
 
 		 415 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.68 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 290 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  28.08 
 
 		 305 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.56 
 
 		 307 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.43 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  33.56 
 
 		 273 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 291 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 292 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  28.48 
 
 		 295 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  33.57 
 
 		 348 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  34.31 
 
 		 292 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 295 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.45 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  30.46 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  27.03 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 294 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.79 
 
 		 288 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 381 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  30.56 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  30.07 
 
 		 393 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  36.5 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  27.82 
 
 		 315 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 289 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.88 
 
 		 314 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 		 386 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 275 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.38 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.38 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  29.61 
 
 		 317 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  28.89 
 
 		 296 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  32.17 
 
 		 288 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  30.99 
 
 		 321 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  29.14 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  30.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1914  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  26.9 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>