175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3045 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  324  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  40.29 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  36.6 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.45 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  38.85 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  37.86 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.9 
 
 		 291 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  36.62 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.71 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.29 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.56 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35 
 
 		 307 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  36.96 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  34.51 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 290 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 293 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.77 
 
 		 288 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.99 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 297 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  32.87 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.31 
 
 		 284 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  31.69 
 
 		 302 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 293 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.46 
 
 		 321 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.34 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  32.68 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.89 
 
 		 315 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.77 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  32.87 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.77 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  31.76 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  34.18 
 
 		 302 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 		 300 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  31.51 
 
 		 273 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  35.42 
 
 		 281 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  36.6 
 
 		 304 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.17 
 
 		 302 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1869  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.88 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 294 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  34.51 
 
 		 288 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.88 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  31.29 
 
 		 287 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.19 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.33 
 
 		 285 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 293 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 289 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.94 
 
 		 297 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.29 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.25 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 292 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  29.41 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 289 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.41 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 292 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.97 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 297 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.46 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2254  UspA domain protein  33.8 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000796673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>