111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2254 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2254  UspA domain protein  100 
 
 
189 aa  362  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000796673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.43 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
300 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.71 
 
 
288 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
147 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.06 
 
 
284 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  32.62 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
294 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.08 
 
 
288 aa  55.1  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  24.66 
 
 
289 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 
291 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  33.81 
 
 
339 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  33.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  33.12 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
293 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.14 
 
 
308 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  33.1 
 
 
302 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.19 
 
 
303 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  31.21 
 
 
288 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.85 
 
 
299 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  32 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  31.62 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  24.82 
 
 
345 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  25.55 
 
 
341 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.62 
 
 
155 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  36.44 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  30.88 
 
 
155 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  30.88 
 
 
155 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  30.88 
 
 
155 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  30.88 
 
 
155 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  30.88 
 
 
155 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  30.57 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  29.61 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  26.45 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  32.21 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  29.71 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.09 
 
 
317 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.57 
 
 
287 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  29.25 
 
 
192 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  34.34 
 
 
300 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
297 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.46 
 
 
321 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  31.4 
 
 
310 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.36 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
294 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  23.57 
 
 
139 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.25 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
277 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.03 
 
 
292 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  33.8 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 
306 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  30.53 
 
 
295 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  32.19 
 
 
288 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1869  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.34 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  30.66 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.05 
 
 
300 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.33 
 
 
285 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
298 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  37.5 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  34.39 
 
 
324 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  29.03 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.91 
 
 
288 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
296 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  25.68 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
293 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.06 
 
 
289 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  33.57 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.41 
 
 
293 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.1 
 
 
308 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
343 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
293 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.59 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.33 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.59 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.33 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.57 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  23.61 
 
 
149 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  32.87 
 
 
321 aa  42  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  26.9 
 
 
153 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 
277 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>