41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1869 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1869  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  270  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.23 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  46.85 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.64 
 
 		 285 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  34.26 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.78 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  35.56 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 275 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  32.11 
 
 		 300 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  40.38 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 275 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 293 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  37.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.48 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2254  UspA domain protein  35.61 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000796673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.48 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  26.92 
 
 		 284 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  37.19 
 
 		 322 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.29 
 
 		 307 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.82 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  32.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  52.94 
 
 		 296 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.71 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  28.21 
 
 		 315 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 		 156 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  32.8 
 
 		 281 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.66 
 
 		 151 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>