245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1122 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  98.66 
 
 
299 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  43.94 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  43.94 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  43.94 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  39.39 
 
 
272 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  37.73 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
274 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  35.51 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 
280 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  38.33 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  35.36 
 
 
246 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  35.5 
 
 
261 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 
261 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 
261 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.91 
 
 
295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.91 
 
 
295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.91 
 
 
295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.83 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.5 
 
 
347 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.11 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.33 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.99 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
288 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.62 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.95 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
245 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.21 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.79 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
292 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.72 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.08 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.68 
 
 
288 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.72 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  44.7 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.99 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.22 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.23 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.44 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.95 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  41.14 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.67 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  33.95 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.29 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  33.2 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  36.52 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.71 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.71 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  29.53 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.62 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.78 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  36.94 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.02 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  39.26 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  29.22 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.18 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.73 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.73 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.73 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  34.7 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  37.43 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.09 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.74 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.67 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.47 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  35.25 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  33.19 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>