More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1559 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  56.16 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  37.67 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.17 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.56 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.19 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.66 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.87 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.01 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.86 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.29 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  31.33 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.25 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  31.97 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  32.43 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.97 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.07 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  32.17 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  28.67 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.41 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.03 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  31.21 
 
 		 303 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  32.19 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  30.07 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.67 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  30.2 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.67 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  29.33 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.61 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.05 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  26.97 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  29.29 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  25.35 
 
 		 208 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  25.81 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.17 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  28 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.66 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  29.53 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  28.85 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  26.39 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  27.78 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.3 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.97 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  36.67 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.14 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  36.67 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.51 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.61 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  29.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  29.66 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  24.49 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  31.03 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  28.75 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.81 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.5 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.08 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  28.47 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  27.33 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.4 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.08 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  30.82 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  27.46 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  30.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  30.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  30.82 
 
 		 315 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  26.53 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  28.48 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  34.41 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  30.77 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  30.82 
 
 		 315 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.1 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>