More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2622 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  53.42 
 
 		 146 aa  167  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.14 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.94 
 
 		 294 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.06 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  27.34 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.29 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.99 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  32.43 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  29.93 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.69 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.25 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.86 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  25.18 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  29.08 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  32.93 
 
 		 622 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.73 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.06 
 
 		 317 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  27.97 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.54 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  26.24 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 449 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 300 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  26.97 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  28.26 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  28.26 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  23.57 
 
 		 297 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  27.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  28.26 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.71 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  25.16 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  27.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  26.62 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.9 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.34 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  29.73 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  29.73 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.14 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.87 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.5 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  24.82 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  23.08 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  30.28 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  29.86 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  26.62 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.54 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  30.07 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.83 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  26.09 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  29.17 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  27.7 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  24.55 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.57 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  26.39 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  28.78 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  27.27 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  24.66 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>