More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1284 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  60.14 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.29 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.69 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.41 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.29 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.51 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.29 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.59 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.8 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.37 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  29.08 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  29.45 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  30.46 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.95 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.17 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.77 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.21 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.87 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  27.59 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  29.73 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  30.2 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.21 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.07 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.89 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.86 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.5 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  29.86 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.57 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.5 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.97 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  30.07 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  27.08 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  29.8 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  26.76 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  28.57 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  24.65 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  30.82 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  26.57 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.39 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.56 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  28.48 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  27.4 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  28.95 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.94 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  28.93 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  31.29 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  26.21 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  28 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  28.1 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>