More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0816 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  60.14 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.99 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.91 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.93 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.87 
 
 		 212 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.03 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.97 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  26.9 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  29.93 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  30.82 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  28.77 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.17 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.99 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.58 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  26.9 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  29.61 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  30.2 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.87 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  29.05 
 
 		 317 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.07 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.17 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.77 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  29.17 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.53 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.17 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.86 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.32 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.5 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  30.92 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  30.92 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  26.62 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.39 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.4 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.87 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.45 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  29.25 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  26.76 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.12 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.76 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28.77 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.47 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.19 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25.35 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  28.57 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>