More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1231 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 
162 aa  332  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  65.07 
 
 
162 aa  199  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  56.16 
 
 
147 aa  168  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  160  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  48.63 
 
 
150 aa  156  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  51.37 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  49.01 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  48.34 
 
 
152 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  48.34 
 
 
152 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  47.68 
 
 
152 aa  147  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  52.41 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  42.33 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  46.53 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  42.33 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  45.07 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  46.43 
 
 
166 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  48.28 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
164 aa  121  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  42 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.55 
 
 
145 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  37.5 
 
 
150 aa  110  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  40.85 
 
 
142 aa  97.4  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  35.92 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.24 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.81 
 
 
290 aa  90.5  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.3 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.14 
 
 
150 aa  84  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.77 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.24 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.48 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  34 
 
 
309 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.27 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.18 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  35 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.17 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.17 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  33.1 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.54 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.27 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.97 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.17 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.14 
 
 
297 aa  73.9  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  33.8 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  28.08 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.81 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.94 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.39 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.72 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.77 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.73 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.89 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  33.8 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  32.28 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  32.28 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  32.28 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  32.28 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.87 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.28 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  33.1 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.65 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.82 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  31.58 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.32 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.13 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.13 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.82 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  32.26 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  31.47 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>