More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1848 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  100 
 
 
147 aa  293  7e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  58.22 
 
 
162 aa  174  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  56.16 
 
 
162 aa  168  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  48.63 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  47.95 
 
 
150 aa  140  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  45.89 
 
 
150 aa  137  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  51.37 
 
 
148 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  49.66 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
152 aa  123  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
152 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  42.18 
 
 
152 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 
166 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 
166 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  42.18 
 
 
152 aa  120  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  42.18 
 
 
152 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  43.36 
 
 
166 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  42.47 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  41.78 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  44.3 
 
 
154 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  41.45 
 
 
164 aa  110  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
155 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42.67 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  35.86 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  36.11 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.03 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.45 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.95 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  34.69 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.25 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.88 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.97 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.89 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.51 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  34.46 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  36.3 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
155 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  33.8 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.1 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35.14 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  33.78 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.86 
 
 
320 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.46 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.1 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.08 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.99 
 
 
156 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
323 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.57 
 
 
287 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.66 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.21 
 
 
415 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  33.56 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.41 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  36.55 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.64 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.46 
 
 
173 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.73 
 
 
187 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.87 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.41 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.29 
 
 
169 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  32 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.04 
 
 
297 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  32.64 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.43 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  34.93 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  33.96 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.77 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  30.41 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>