More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3008 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  37.2 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  35 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  30.63 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  32.3 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  34.16 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  33.12 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.37 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.4 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  31.29 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.85 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  36.31 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.65 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.57 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  32.48 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.63 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.39 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.91 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  33.96 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.68 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.93 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  33.12 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  30.17 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.97 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.57 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.49 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.56 
 
 		 283 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.76 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  31.45 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.41 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.69 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.06 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.76 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.86 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.4 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  31.41 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  28.05 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.9 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.96 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.44 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.85 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  31.01 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.39 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  29.75 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.19 
 
 		 294 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  32.3 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  50.94 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.38 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.49 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  29.22 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  31.58 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.77 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.32 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.3 
 
 		 307 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.94 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.06 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  28.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.3 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  28.39 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.11 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  42.5 
 
 		 297 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>