More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1466 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  276  7e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  54.48 
 
 
141 aa  142  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  53.19 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  53.42 
 
 
143 aa  138  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  46.53 
 
 
140 aa  123  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  48.94 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  48.59 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  45.77 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 
137 aa  115  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.94 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  43.06 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.1 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.42 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.58 
 
 
180 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.76 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.77 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  39.31 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.37 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.64 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  38.1 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.01 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  39.46 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.49 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.69 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.56 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  35.86 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  33.79 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  36.36 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  34.25 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  33.79 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  34.25 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  34.25 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  34.25 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.6 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  34.25 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.23 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  35.42 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  33.79 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.1 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.3 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.03 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  38.3 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  37.76 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  36.42 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  33.79 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  37.58 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  33.09 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  33.1 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  36.49 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.55 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.1 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  38.03 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.25 
 
 
165 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.25 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  37.59 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.94 
 
 
297 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  37.59 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  33.77 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.64 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.72 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  35.81 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.73 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  34.23 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.03 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.29 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.77 
 
 
307 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.11 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>