More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1273 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  100 
 
 
166 aa  344  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  89.76 
 
 
166 aa  315  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  89.76 
 
 
166 aa  315  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  55.03 
 
 
152 aa  167  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  54.36 
 
 
152 aa  166  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  55.56 
 
 
152 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  56.25 
 
 
152 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  52.05 
 
 
149 aa  163  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  52.45 
 
 
148 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  47.22 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  46.43 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  45.45 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  43.57 
 
 
150 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  46.81 
 
 
145 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  43.24 
 
 
154 aa  120  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  43.36 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.71 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  40.71 
 
 
150 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.06 
 
 
146 aa  114  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
164 aa  105  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
155 aa  92.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  39.46 
 
 
143 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  36.62 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.67 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.67 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.18 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.78 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  36.3 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.33 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  32.28 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.28 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.12 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.12 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.12 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.12 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.21 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.12 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.08 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.12 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35.97 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.55 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.29 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  30.06 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.82 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.47 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.97 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  30.63 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  30.63 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32.21 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.89 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000238748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  33.55 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  32.67 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32.41 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.29 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.03 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.23 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.43 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36.05 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.93 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  31.41 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32.9 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.84 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.88 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.25 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.86 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.82 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.79 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.17 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.21 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.32 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>