More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3551 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  93.2 
 
 
147 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  91.16 
 
 
148 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  91.16 
 
 
148 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  91.16 
 
 
148 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  76.19 
 
 
146 aa  224  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  62.16 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  53.69 
 
 
148 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  53.69 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  55.7 
 
 
149 aa  137  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  55.7 
 
 
152 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  51.66 
 
 
152 aa  123  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  53.03 
 
 
133 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.1 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.25 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.17 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.45 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.38 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40.69 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  34.39 
 
 
166 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.43 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.52 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.37 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  35.17 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.85 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.81 
 
 
317 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.14 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.33 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
295 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.57 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.93 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
295 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.72 
 
 
295 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  29.86 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.37 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.53 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  38.81 
 
 
342 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.17 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.17 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.1 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  32.69 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.14 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  26.67 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.21 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.67 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.89 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.26 
 
 
142 aa  52  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.57 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.22 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.21 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.53 
 
 
162 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.76 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  30.56 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.45 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.28 
 
 
164 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>