More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3847 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  100 
 
 
145 aa  296  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.48 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.25 
 
 
143 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  34.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  32.03 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  34.72 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30.61 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30.61 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30.61 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30.61 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30.61 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  37.24 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30.61 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.86 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.61 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  31.29 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30.61 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  33.79 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  34.48 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.58 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  37.24 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.41 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  36.99 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  36.55 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  36.55 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.86 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.33 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.21 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.01 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.76 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
170 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  32.43 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.51 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.41 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.34 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  33.78 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  30.63 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.2 
 
 
317 aa  63.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.48 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.53 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  29.93 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.55 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  32.67 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  28.97 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.25 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.25 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.82 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1796  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1762  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.47 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.9 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  31.82 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.37 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  27.45 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  31.25 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.25 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  35.1 
 
 
303 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.99 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  30.67 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  32.12 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.08 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>