188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1796 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1762  UspA domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  270  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1796  UspA domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  270  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1269  universal stress protein  86.86 
 
 
137 aa  239  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.779976  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  35.04 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2220  universal stress protein  32.87 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.344248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  39.29 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.71 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.94 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  32.14 
 
 
293 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.56 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.54 
 
 
310 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.08 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.43 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  30 
 
 
293 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.17 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.21 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  24.65 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.46 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  28.3 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  27.4 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.26 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  25.69 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  25.33 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.46 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  25 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  37.1 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  24.31 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.71 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.46 
 
 
287 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  27.52 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  26.03 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  25.55 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  26.43 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
128 aa  48.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.24 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.66 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  33.73 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.93 
 
 
320 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.34 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  25 
 
 
153 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  29.45 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.61 
 
 
304 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
164 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  24.29 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  27.94 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  22.38 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 
543 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  24.29 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  25.53 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  20.29 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 
290 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  24.66 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  25.52 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  26 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.24 
 
 
307 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  21.58 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  32.56 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  24.14 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  24.82 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  26.57 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  24.83 
 
 
310 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  25.32 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  30.38 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  28.08 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  24.82 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.92 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  27.27 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  27.14 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.2 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4517  universal stress protein  26.35 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0300457  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.79 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.32 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>