181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1269 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1269  universal stress protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.779976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1762  UspA domain-containing protein  86.86 
 
 		 137 aa  239  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1796  UspA domain-containing protein  86.86 
 
 		 137 aa  239  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  36.5 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2220  universal stress protein  30.77 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.344248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  36.43 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.71 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.17 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 140 aa  57  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.22 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  31.43 
 
 		 293 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.45 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.69 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.08 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.68 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  25.36 
 
 		 310 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.91 
 
 		 287 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  24.82 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  28.57 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.62 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  39.68 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.37 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  25.83 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  26.71 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.08 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  25.36 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.18 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  25.83 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.95 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.71 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.06 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.83 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  30.07 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  30.34 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  35 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.34 
 
 		 283 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.62 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  32.18 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  26.14 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  25.69 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  26.9 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  30.1 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  25.36 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  28.78 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  24.48 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  23.24 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 543 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  31.25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  24.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  23.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.71 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 290 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  27.06 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  26.21 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  25.9 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.66 
 
 		 320 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.57 
 
 		 307 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  25.71 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  24.82 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  44.64 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  24.5 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  25.85 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  28.57 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.71 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  26.35 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  25.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  29.05 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  30.12 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>