More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0134 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  72.34 
 
 
140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  71.63 
 
 
140 aa  207  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  68.79 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  68.79 
 
 
140 aa  193  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  68.09 
 
 
140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  69.5 
 
 
140 aa  176  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  56.03 
 
 
140 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  58.87 
 
 
140 aa  155  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  55.63 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  43.26 
 
 
140 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  41.55 
 
 
141 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.93 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.47 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  33.79 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  31.97 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  44.3 
 
 
156 aa  67  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.71 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  32.67 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  31.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.28 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.67 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.79 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  34.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  31.65 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.75 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  34.23 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  31.47 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  30.43 
 
 
345 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  32 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  34.23 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  34.23 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.07 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.71 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  29.09 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.54 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.86 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.69 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.79 
 
 
286 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.97 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.29 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 
324 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.78 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  43.68 
 
 
276 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.26 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.21 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  41.54 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  41.54 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  27.66 
 
 
287 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  33.78 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  33.33 
 
 
306 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.03 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  40.7 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  29.17 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 
287 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  25.93 
 
 
171 aa  53.9  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 
297 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  44.59 
 
 
281 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.25 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  26.57 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  28.37 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  41.54 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.09 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.58 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.43 
 
 
297 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  28.33 
 
 
282 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.44 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  39.77 
 
 
278 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  28.78 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  33.33 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  25.53 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  27.1 
 
 
321 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  29.05 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  47.06 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
284 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.03 
 
 
305 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>