More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0023 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  100 
 
 
137 aa  273  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  49.64 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  45.71 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  44.29 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  44.29 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  44.29 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  44.29 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  44.29 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  44.29 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  44.29 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  44.29 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  45 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 
140 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1796  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1762  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1269  universal stress protein  36.5 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.779976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.69 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  33.79 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.47 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.16 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  31.33 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.56 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.29 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2220  universal stress protein  29.86 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.344248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.62 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.48 
 
 
305 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  25.55 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.08 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.43 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.74 
 
 
287 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.33 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  27.27 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.67 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  31.29 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.58 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.65 
 
 
142 aa  57.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  25.85 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  28.37 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  27.21 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.93 
 
 
294 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.5 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.66 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  29.58 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
290 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  29.68 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.87 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  27.78 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  27.54 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  24.64 
 
 
207 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  29.93 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  28.28 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  26.76 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.17 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  29.17 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25 
 
 
164 aa  53.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
156 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  26.81 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
291 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  29.17 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  32.88 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.57 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  27.97 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  27.74 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  28.97 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.24 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  31.79 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.74 
 
 
278 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 
313 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  23.91 
 
 
297 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  29.75 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  41.82 
 
 
293 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  27.34 
 
 
144 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  27.08 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  35.8 
 
 
171 aa  52  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.07 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.07 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  40 
 
 
293 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>