More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2611 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  295  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  56.85 
 
 
303 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  58.11 
 
 
151 aa  134  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  47.3 
 
 
300 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  57.05 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  47.65 
 
 
295 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  48.65 
 
 
297 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  43.15 
 
 
296 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38.51 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.24 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  47.3 
 
 
297 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 
137 aa  87  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  40.69 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  39.16 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.84 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  38.3 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  43.42 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  43.79 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.03 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1819  hypothetical protein  51.35 
 
 
182 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  43.75 
 
 
297 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  38.3 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.81 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  39.86 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  39.86 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.41 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.93 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.91 
 
 
320 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.17 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.11 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.37 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  42.47 
 
 
280 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  39.86 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.27 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  36.3 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.89 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.36 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.55 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
300 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  39.46 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  35.57 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.99 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  40.97 
 
 
317 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.47 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.37 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  37.41 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.93 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.56 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  33.11 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.77 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  38.89 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.87 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  34 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  37.24 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  38.73 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.57 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.77 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  35.81 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  32.87 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  39.19 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  32.65 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.19 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.51 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.73 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.51 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.87 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>