238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1741 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  34.53 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.58 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  34.29 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  31.88 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.08 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.8 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  39.29 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.77 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  28.57 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  30.15 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  27.97 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.24 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.76 
 
 		 296 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.86 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  25.18 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.62 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.46 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.17 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  36.36 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.09 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.29 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  28.47 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  25.87 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.66 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.25 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  40.74 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.36 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.17 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  28.57 
 
 		 295 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  28.24 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28.07 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.79 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.78 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.01 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  37.88 
 
 		 288 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25.71 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.31 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  29.37 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.47 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  31.08 
 
 		 295 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  26.57 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  47.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  31.52 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.66 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.32 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.53 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.32 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.76 
 
 		 295 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1269  universal stress protein  32.18 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.779976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.29 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.44 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.21 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  30.6 
 
 		 284 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  28.67 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>