More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4517 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4517  universal stress protein  100 
 
 		 150 aa  293  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0300457  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  57.43 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  47.65 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  49.32 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  46.31 
 
 		 156 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  47.97 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  43.92 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  43.92 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  42.28 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  43.33 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  38.26 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  38.26 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  38.93 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  41.5 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  41.5 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 153 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  41.33 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  39.6 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  42 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  42 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  42 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  42 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  42 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  42 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.33 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  41.38 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  38.62 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  40.67 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.16 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.16 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.55 
 
 		 187 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  36.91 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  36.67 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  38.82 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.86 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1206  hypothetical protein  39.86 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  37.5 
 
 		 191 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.17 
 
 		 155 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  37.5 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  35.62 
 
 		 184 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36.3 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  37.5 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  35.81 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.72 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.31 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.3 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  29.73 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  35.33 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.34 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  37.33 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>