More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0260 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  100 
 
 
155 aa  310  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  64.14 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.08 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.21 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.37 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.33 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.77 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.1 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  38.78 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.78 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.78 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.68 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  34.9 
 
 
317 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.72 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.33 
 
 
293 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  33.55 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
293 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.87 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  35.14 
 
 
295 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  35.1 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  35.1 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.49 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  32.69 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.86 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.73 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  32.61 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 
287 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34 
 
 
293 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  33.33 
 
 
309 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.17 
 
 
288 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.48 
 
 
303 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.17 
 
 
288 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.95 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  31.45 
 
 
292 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  32.69 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  32.43 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.89 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.2 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.17 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  50 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  35.15 
 
 
298 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  35.15 
 
 
298 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  35.15 
 
 
298 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.85 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
293 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
293 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  32.21 
 
 
317 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.34 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40.48 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  31.09 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.85 
 
 
317 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.26 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  30.07 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.67 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.64 
 
 
291 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.41 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.64 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  46.27 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.89 
 
 
299 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.58 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.47 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  34.67 
 
 
373 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  39.33 
 
 
282 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.08 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.56 
 
 
300 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.46 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  29.49 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.03 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  39.33 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.14 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  39.33 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
294 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.2 
 
 
301 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
293 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  27.94 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>