More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1331 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  100 
 
 
140 aa  270  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  100 
 
 
140 aa  270  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  98.57 
 
 
140 aa  269  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  86.43 
 
 
140 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
145 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.57 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  36.55 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.81 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  38.3 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40.14 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  38.03 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  38.1 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  38.1 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  36.18 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  31.69 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  38.46 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.29 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.23 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 
298 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  40.85 
 
 
298 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  39.73 
 
 
300 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  34.53 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 
298 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.03 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.86 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.14 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  39.16 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  38.46 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.5 
 
 
294 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  40.14 
 
 
303 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  39.86 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.42 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  36.3 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  41.22 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  31.29 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.97 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.29 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  32.88 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.39 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  32.62 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34.93 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
317 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  31.13 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  36.11 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  38.3 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  32.14 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  35.66 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.69 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.8 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.37 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  36.49 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.44 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.21 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  35 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.01 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  36.43 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  36.88 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  38.19 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.8 
 
 
314 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>