134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0583 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0583  UspA domain protein  100 
 
 		 150 aa  290  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  54.79 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3208  UspA domain protein  52.7 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118961  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.93 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  32.12 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.86 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  35.07 
 
 		 295 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  26.39 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  36.23 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.51 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.47 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  36.23 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  33.81 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.06 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.65 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.62 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.91 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.82 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  29.45 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.51 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.29 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  34.78 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 449 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  31.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  31.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  31.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  31.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.37 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  36.88 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.97 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.46 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  28.37 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  26.24 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  36.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  28.37 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  30.22 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  32.87 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  25.74 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.17 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.54 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.56 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.8 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.75 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.01 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  24.64 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.21 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  24.31 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  27.59 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  30.5 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  30.87 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.97 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  30.66 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  32.17 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.66 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  34.97 
 
 		 296 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  28.19 
 
 		 307 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.94 
 
 		 153 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>