More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0095 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  66.24 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  53.06 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  46.88 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.46 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.42 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.19 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.71 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.19 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.9 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.9 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  35.25 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  38.13 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.81 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  38.13 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  37.97 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  37.97 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  36.69 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.92 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  35.51 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36.62 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  36.62 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.28 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  39.51 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32.67 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.37 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  32.61 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.41 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.15 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.88 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  34.4 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  31.11 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  32 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  34.4 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  32 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  34.04 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  29.29 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.7 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  36.36 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  45.76 
 
 		 295 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  34.4 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  28.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  33.78 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.19 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.37 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.57 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.99 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  41.54 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.58 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.71 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  28.4 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  30.2 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.89 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  33.07 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  31.72 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.7 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.61 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  49.06 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  27.56 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.86 
 
 		 314 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  46.55 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  45.9 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  30.56 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.71 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  47.37 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40.74 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  29.93 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.68 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  34.02 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  30.38 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.57 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>