More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2127 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  91.61 
 
 		 143 aa  236  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  49.65 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  41.26 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  37.67 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  44.06 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  35.86 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  37.93 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  38.3 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  33.56 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.91 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.65 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.03 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  35.42 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  29.73 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.77 
 
 		 140 aa  66.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.48 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.25 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  30.77 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  36.55 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.93 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.99 
 
 		 287 aa  63.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  32.24 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.34 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  29.37 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  34.27 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.47 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  34.75 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.03 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  37.24 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.17 
 
 		 297 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.14 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.56 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.69 
 
 		 320 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  33.77 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.21 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  36.05 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  30.99 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  29.08 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.17 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.62 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  27.89 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.64 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.66 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  29.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  31.69 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  39.53 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.91 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  25.85 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  27.03 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  27.03 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  37.89 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.05 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  31.08 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.93 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.08 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  32.47 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.08 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  29.61 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  30.14 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.99 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  32.47 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.45 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  34.67 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  29.37 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.21 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>