More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3142 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  100 
 
 		 162 aa  313  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  99.38 
 
 		 162 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  57.76 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  61.18 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  58.23 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  41.45 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.75 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  34.27 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.09 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  37.24 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  34.01 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32.64 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.21 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.47 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.72 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.57 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  29.66 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  37.24 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.55 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  31.97 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  29.8 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  30.14 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  32.45 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  32.45 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.37 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.97 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.17 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.86 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  28.47 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  33.79 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.06 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  29.37 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  25.97 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.76 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  31.21 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.41 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.34 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30.52 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.37 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.37 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  26.21 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.47 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  23.78 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.12 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.78 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  27.52 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.61 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.48 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.38 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  30.26 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  28.86 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.06 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.25 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  29.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  25.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  29.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  31.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.89 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  28.87 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  29.86 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.25 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  32.89 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  29.2 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  27.08 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.34 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  30.07 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.25 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>