More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4348 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  100 
 
 
149 aa  288  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  44.44 
 
 
167 aa  110  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.1 
 
 
155 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.01 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.78 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  39.31 
 
 
297 aa  90.1  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.84 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.21 
 
 
151 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  41.61 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.19 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.17 
 
 
208 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.81 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.36 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.71 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.21 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.88 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  38.3 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.62 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.34 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.76 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.55 
 
 
286 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  38.51 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.01 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.08 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.86 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  35.17 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  36.11 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.24 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32 
 
 
288 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  35.71 
 
 
301 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  33.8 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.48 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.48 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.64 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.48 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36.73 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  37.58 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34.48 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.48 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.66 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  35.29 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.54 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  32.86 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.03 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.67 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.87 
 
 
307 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.55 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.25 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.48 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.34 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  35.42 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.81 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  33.56 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.23 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.94 
 
 
281 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.82 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.72 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.34 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.57 
 
 
300 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  30.91 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.93 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.79 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.79 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.5 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  35.14 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  31.85 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.79 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.79 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.79 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.44 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.03 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.79 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>