72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4157 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4157  putative universal stress protein UspA  100 
 
 		 168 aa  329  9e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  35.97 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  38.69 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.09 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  35.46 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  34.03 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  34.03 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  31.03 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  37.18 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  34.72 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  35.46 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.58 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  28.87 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.15 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  29.66 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  32.64 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  23.45 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  27.08 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  28.24 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  27.86 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  28.87 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  29.45 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  23.94 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  28.37 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.09 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  26.76 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.61 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  25.83 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  26.09 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  25.9 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  25.9 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  25.49 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  31.82 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25.36 
 
 		 286 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.73 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  22.54 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  27.27 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 310 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  23.57 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  24.46 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  25.49 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  28.43 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  33.58 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  20.98 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  25.87 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  23.19 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.97 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>