85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1790 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  49.04 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  47.42 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  43.18 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  42.31 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  37.03 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  25.31 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  27.56 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  28.05 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  33.57 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.87 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  28.92 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  28.12 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  27.35 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  26.11 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  27.67 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  22.98 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  25.73 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.26 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.26 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.26 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  23.65 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.05 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  24.73 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.32 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  23.69 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 159 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.5 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  24.19 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  24.55 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  22.05 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  22.65 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  28.76 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.03 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  22.65 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  22.65 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  26.6 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  25.13 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  25.91 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.4 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 140 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  28.02 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  26.23 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  27.08 
 
 		 321 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.07 
 
 		 141 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  28.02 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  24.23 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  28.02 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.74 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  25.67 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.08 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  25.68 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.56 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.35 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  22.4 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  26.74 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  20.65 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.38 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.66 
 
 		 139 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  23.74 
 
 		 154 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  28.39 
 
 		 140 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  26.32 
 
 		 211 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  27.81 
 
 		 152 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  27.22 
 
 		 141 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>