More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0806 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  59.26 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  41.3 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  34.25 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  30.94 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.56 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.46 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.04 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  36.62 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.56 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.3 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.51 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.79 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.53 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.71 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  35.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.53 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  29.58 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.29 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  39.16 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  35.07 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.91 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.66 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.28 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.66 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.94 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.71 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.97 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.62 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  31.47 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  31.85 
 
 		 282 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.28 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.5 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.99 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  30.94 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  34.44 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  33.56 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  33.56 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.91 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30.34 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.72 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.06 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.43 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  31.91 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.71 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.29 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  29.66 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  36.78 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.82 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.79 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.82 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.81 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  34.01 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  26.81 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>