More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0954 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  100 
 
 
140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  41.13 
 
 
138 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.92 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  32.87 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.97 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.61 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  31.08 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.78 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  35.97 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.65 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.03 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  38.89 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.65 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  33.56 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  32 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.25 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.53 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.39 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  35.58 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  34.93 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.87 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  32.17 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.86 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  31.41 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  35.62 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  66.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.86 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.61 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.04 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.33 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.57 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.57 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.25 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  32.17 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  37.16 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.48 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  33.33 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.46 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.56 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.03 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.43 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.99 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.8 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.99 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  51.85 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.25 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.39 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.81 
 
 
299 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.28 
 
 
305 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.14 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  32.08 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.94 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.71 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.17 
 
 
320 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.88 
 
 
217 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.94 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  32.08 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.57 
 
 
314 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
274 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  27.56 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  31.08 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.57 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  31.37 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.57 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  32.64 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  32.35 
 
 
280 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  30.14 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.99 
 
 
290 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>