More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3500 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  75.18 
 
 
283 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  75.18 
 
 
283 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  59.36 
 
 
306 aa  355  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  58.66 
 
 
283 aa  344  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  57.39 
 
 
287 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  56.07 
 
 
306 aa  322  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  51.79 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  42.55 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  41.99 
 
 
282 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.92 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  23.43 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  25.75 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.16 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26.96 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  26.09 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  24.65 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  23.89 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  29 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
142 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  22.9 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.41 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  30.37 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  34.23 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  30.2 
 
 
147 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.07 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.4 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
141 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  24.66 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.1 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
138 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.18 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  24.49 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  22.22 
 
 
320 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  39.29 
 
 
164 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  27.21 
 
 
145 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.07 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  25 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  45 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.62 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  38.1 
 
 
164 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.35 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
145 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.85 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  24.84 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  33.67 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  24.71 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.24 
 
 
141 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  25.24 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.4 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  26.95 
 
 
142 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  29.8 
 
 
146 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
138 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  46.3 
 
 
135 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  27.01 
 
 
151 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  23.24 
 
 
139 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.67 
 
 
164 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  32.65 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  23.85 
 
 
289 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  24.53 
 
 
304 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  46.3 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  21.61 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  32.04 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  32.04 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  46.3 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  47.17 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  32.04 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
128 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
134 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  31.71 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
144 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  27.62 
 
 
314 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.6 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  36.47 
 
 
137 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  24.71 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28 
 
 
152 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 
144 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  45.61 
 
 
131 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  33.73 
 
 
152 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  40.74 
 
 
150 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
148 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  25.48 
 
 
162 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 
135 aa  49.7  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.05 
 
 
153 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.62 
 
 
140 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  26.35 
 
 
173 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  25.35 
 
 
151 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  24.62 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  35.06 
 
 
145 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  36.51 
 
 
152 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  31.07 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.83 
 
 
170 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 
147 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.83 
 
 
170 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 
147 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 
145 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  24.67 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>