220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0473 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  83.27 
 
 
282 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  48.92 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  47.37 
 
 
306 aa  249  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  45.74 
 
 
283 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  44.18 
 
 
287 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  45.04 
 
 
283 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  45.04 
 
 
283 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  40.93 
 
 
280 aa  228  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  41.99 
 
 
283 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  25.74 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.71 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.67 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  26 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  24.41 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.44 
 
 
148 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  37.93 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.11 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.64 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.67 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.57 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  25.6 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.93 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
285 aa  55.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  25 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  23.57 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  29.41 
 
 
137 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
138 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  29.93 
 
 
135 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
128 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  33.33 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  25.61 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  24 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  30.15 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.71 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  37.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  37.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
138 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  27.66 
 
 
143 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.97 
 
 
155 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  27.46 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.28 
 
 
140 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
128 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  40.91 
 
 
145 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.79 
 
 
141 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  30.15 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  27.74 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  27.66 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.87 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  21.47 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.23 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  24.41 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  30.08 
 
 
126 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 
135 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.75 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.64 
 
 
137 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.37 
 
 
141 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.62 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.94 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  33.02 
 
 
150 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  29.13 
 
 
136 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 
142 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  52.08 
 
 
166 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  34.04 
 
 
152 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.86 
 
 
152 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  40.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
137 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.54 
 
 
140 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 
325 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.18 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  32.26 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.57 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  25.42 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  47.37 
 
 
131 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.34 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  27.56 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  26.36 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.78 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.96 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  38.98 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  26.98 
 
 
285 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  22.94 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 
137 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  28.03 
 
 
151 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.93 
 
 
154 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 
279 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  23.44 
 
 
301 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  25.27 
 
 
301 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  40.74 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
138 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 
140 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>