More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2102 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  100 
 
 		 289 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.63 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.38 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.8 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  32.17 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.59 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.07 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.93 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  31.46 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  27.92 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.06 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.92 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.83 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.29 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  40.85 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.21 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.9 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.3 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.44 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.16 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 148 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28.42 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.27 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.21 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  28.99 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  33.81 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36.14 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.32 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  32.41 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.17 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.5 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.95 
 
 		 157 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 147 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.99 
 
 		 150 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.88 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.6 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  35.66 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.07 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  38.36 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  39.58 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.72 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.56 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  39.58 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.65 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.76 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  34.69 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.41 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.93 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.96 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  35.92 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.78 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.35 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  30.66 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.47 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  33.82 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.96 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  35.46 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  31.08 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.07 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  27 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  33.79 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36.05 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  23.89 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.92 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  29.9 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  27.33 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  19.79 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  33.79 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.45 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>