35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0181 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  25.47 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 307 aa  60.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  27.88 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  29.56 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  30.68 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 313 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 313 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  26.16 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 309 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  24.71 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  30.84 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.45 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  32.61 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.85 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  27.44 
 
 		 288 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  26.49 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.49 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  34.38 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.29 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  29.07 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  31.58 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 		 175 aa  40.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>