More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4679 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  282  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  48.15 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.17 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.57 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.48 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.03 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.62 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.47 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.88 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.91 
 
 		 290 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.22 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  35.61 
 
 		 271 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.8 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  36.62 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.82 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  26.92 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.87 
 
 		 305 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  35 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  35 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.91 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.53 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.44 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  35 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  35 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.37 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  30.99 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  35 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  35 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  30.34 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  48.28 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  31.21 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  31.21 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  31.54 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  34.97 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.89 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.79 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.8 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.82 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.35 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.77 
 
 		 292 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  25.87 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  29.41 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.51 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28.57 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.06 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  25.49 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  31.11 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  23.78 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  25.17 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.66 
 
 		 345 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.81 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.7 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  43.06 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.33 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  29.93 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 266 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.49 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.37 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.5 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  28.87 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  27.7 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  27.7 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  26.53 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>