156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1428 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  62.88 
 
 		 136 aa  151  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  52.67 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  49.25 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  42.19 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  47.37 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.23 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  44.53 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  42.97 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  44.12 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  42.97 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  51.56 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  40.3 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  38.93 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  42.19 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  39.72 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  39.06 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  39.69 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  39.69 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  36.84 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  39.53 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  33.59 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  39.84 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  52.78 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  33.86 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.54 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  46.27 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  44 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  53.85 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  44.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  34.21 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  48.94 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  46.81 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  32.81 
 
 		 282 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  33.64 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  44.93 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  42.86 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  38.1 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  53.85 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  29.55 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  43.94 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  39.39 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  40.91 
 
 		 280 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  38.6 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  40.98 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  42.86 
 
 		 221 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.3 
 
 		 309 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 		 291 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  38.78 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  25 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.88 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  46.94 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.26 
 
 		 415 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  42.31 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.67 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  33.82 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  35.82 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  34.67 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 156 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  46.3 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.23 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.23 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.21 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  36.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.26 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.26 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  43.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  34.43 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  43.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  33.01 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  43.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  43.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  43.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  43.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  28.46 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.9 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.92 
 
 		 143 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>