101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  49.62 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  47.01 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  48.51 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  45.19 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  45.99 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  44.12 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  42.22 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  40.74 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  42.22 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  42.22 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  48.15 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  39.29 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  40.3 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  43.38 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  44.44 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  34.59 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  39.26 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  40.74 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  39.39 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  40.74 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  38.64 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  39.71 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  36.23 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  37.59 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  48.75 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  33.82 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  32.84 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  30.94 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  46.43 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  50 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  54.29 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  54.29 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.22 
 
 		 302 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  48.84 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  57.14 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  32.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  50 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  45.71 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  37.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  31.21 
 
 		 285 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  43.64 
 
 		 280 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  41.07 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  31.69 
 
 		 288 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  28.97 
 
 		 313 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  40.74 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.91 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  30.34 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 289 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 289 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.05 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  62.07 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  35.37 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.74 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  50 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.58 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  40 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  42.86 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 290 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  38.18 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  27.03 
 
 		 288 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 298 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  42.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  42.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  42.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  42.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  42.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  42.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  31.21 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  37.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  52.17 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31831  predicted protein  26.45 
 
 		 351 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.36 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  37.84 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.84 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.46 
 
 		 299 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.03 
 
 		 300 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>