112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3296 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  98.46 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  68.99 
 
 		 131 aa  183  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  67.72 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  51.59 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  45.24 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  43.65 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  41.27 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  42.75 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  39.69 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  38.93 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  43.2 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  43.41 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  41.22 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.37 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  39.39 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  38.89 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  46.94 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  39.68 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  38.89 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  35.94 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  58 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  37.5 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  35.88 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  35.11 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  35.11 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  37.18 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  41.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  36.59 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  54.55 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  37.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40.91 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  31.54 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  42.47 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  34.48 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  43.75 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  36.23 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  41.03 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  35.63 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  32.98 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  46.88 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.64 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  44 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  32.5 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  51.22 
 
 		 316 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  43.14 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 293 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  37.74 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  41.51 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  33.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  30.43 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.23 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  32 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  57.89 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.47 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  34.15 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.95 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  38.24 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.55 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  29.07 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.73 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.73 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  39.62 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  42.86 
 
 		 415 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  42 
 
 		 280 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  29.45 
 
 		 191 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.63 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  44.44 
 
 		 300 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  54.76 
 
 		 148 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 283 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 297 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  29.45 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.94 
 
 		 139 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  47.92 
 
 		 143 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 297 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  29.45 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  36 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  32.79 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33.72 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  30.43 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  30.43 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  30.43 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.19 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>