135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2585 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  56.03 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  40.56 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  41.38 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  43.71 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.38 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  39.6 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  37.24 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  36.69 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  36.77 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  37.68 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  31.21 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  39.82 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  41.76 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  32.86 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  45.21 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  34 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  35.48 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  41.03 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  40.26 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  42.03 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  56.6 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  54.9 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  48.21 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  48.21 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  50.91 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  41.43 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  41.1 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  46.15 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.08 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  48.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  49.06 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  45.9 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  41.67 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  42.19 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  40.28 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  28.77 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  42 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  38.57 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  34.15 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  40 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.83 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  41.18 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  43.94 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  43.08 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  42 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  44.23 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  27.46 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.11 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  32.5 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  37.5 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  23.4 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  45.9 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  23.4 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.18 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  40.3 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  22.7 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  24.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  24.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  24.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  32 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  24.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  24.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.5 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  29.05 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  38.89 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.46 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.57 
 
 		 290 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.97 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  40 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  48 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  27.03 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  26.76 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  33 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  36.99 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  29.76 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  35.06 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.38 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  33.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  29.21 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.38 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  38.57 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  28.33 
 
 		 201 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>