31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0044 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  100 
 
 
160 aa  314  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  49.33 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  44.08 
 
 
152 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  41.06 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  41.56 
 
 
161 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  40.26 
 
 
154 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  37.42 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  39.07 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34.29 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  30.56 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  30.23 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  33.33 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  31.21 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  36.07 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  49.06 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  42.42 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  44.62 
 
 
135 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  54.17 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  30.56 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  32.64 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  40.35 
 
 
131 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  56.76 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  40.98 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  38.18 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  38.98 
 
 
146 aa  43.9  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  50 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  36.21 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  41.07 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  38.1 
 
 
133 aa  40.8  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  35.19 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>