135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4215 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  45.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  41.82 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  39.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  37.04 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  36.2 
 
 
151 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  33.72 
 
 
150 aa  97.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  33.54 
 
 
147 aa  84  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  42.25 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  44 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  42.19 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33.11 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  37.97 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  38.35 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.03 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  46.25 
 
 
133 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  33.59 
 
 
130 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  30.77 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  39.24 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  42.17 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  40.51 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  44.29 
 
 
125 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  27.27 
 
 
177 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  41.03 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  36.26 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  42.5 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  30.97 
 
 
221 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40.66 
 
 
142 aa  54.3  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  50.88 
 
 
116 aa  53.9  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  42.25 
 
 
122 aa  53.9  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  33.59 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  27.33 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  35.63 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  37.35 
 
 
122 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  44.64 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  39.77 
 
 
136 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  36.99 
 
 
131 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  41.33 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  32.94 
 
 
122 aa  51.6  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  41.1 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.44 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  23.31 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  41.54 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  23.31 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  38.1 
 
 
133 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  34.09 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  32.31 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  32.29 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  43.55 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  40.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.97 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.58 
 
 
304 aa  47.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 
149 aa  47.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  40.74 
 
 
137 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  30.43 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.3 
 
 
300 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  42.37 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  32.31 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.58 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30.53 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  44.44 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  31.21 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  39.68 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.03 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30.34 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.58 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.83 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  41.51 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  32.18 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  40.98 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  40.7 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  28.66 
 
 
295 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  34.83 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  30.34 
 
 
136 aa  44.3  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  41.82 
 
 
280 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.14 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  31.87 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  36.51 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  23.31 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  36.51 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  36.84 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  34.44 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  28.24 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  28.09 
 
 
324 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.1 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  30.91 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  38.89 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>