68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1302 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  100 
 
 
122 aa  240  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  85.25 
 
 
124 aa  209  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  52.46 
 
 
122 aa  127  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  48.36 
 
 
122 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  51.64 
 
 
122 aa  117  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  34.12 
 
 
161 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.85 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  37.88 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  39.71 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  39.02 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  28.7 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.46 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  29.29 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.14 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.52 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  28.97 
 
 
162 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  28.81 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  34.57 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  39.44 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  40.3 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  32.18 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  29.9 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  33.71 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.9 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  25 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  32.91 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  32.14 
 
 
156 aa  43.5  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  24.64 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  25.74 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  21.17 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  26.09 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.66 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.14 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  43.64 
 
 
151 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  30.3 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  32.93 
 
 
143 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.59 
 
 
143 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
139 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  30.47 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  25.71 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  29.03 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.27 
 
 
273 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  23.45 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  26.87 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  28.06 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.59 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  32.86 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
469 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.59 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.28 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  26.45 
 
 
282 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.34 
 
 
143 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.14 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  34.04 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  26.92 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  30.67 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  25.76 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  25.42 
 
 
242 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  38.37 
 
 
150 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  26.57 
 
 
148 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25 
 
 
139 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>