240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0977 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  48.46 
 
 
133 aa  124  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  45.38 
 
 
135 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  43.65 
 
 
131 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  38.93 
 
 
146 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  37.96 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  36.94 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  44.88 
 
 
134 aa  87  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  36.71 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  37.68 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  36.62 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  31.21 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  37.12 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.28 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  49.09 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  33.33 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  32.62 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  28.48 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  45.83 
 
 
143 aa  61.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  30.77 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  38.89 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  39.44 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  35.79 
 
 
137 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  41.56 
 
 
122 aa  58.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  29.09 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  32.22 
 
 
122 aa  54.3  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  37.5 
 
 
296 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  35.11 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  39.68 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 
128 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  47.92 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.57 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  30.91 
 
 
122 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  34.38 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  44.9 
 
 
116 aa  52  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  47.92 
 
 
130 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  43.64 
 
 
154 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.66 
 
 
143 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  36.42 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 
142 aa  50.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  47.92 
 
 
131 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  48 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  46.77 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.06 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  30.95 
 
 
279 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  41.38 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.67 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  29.6 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  39.34 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  31.94 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.92 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  46 
 
 
129 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  34.85 
 
 
146 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  40.98 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  45.83 
 
 
132 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.2 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  40.32 
 
 
146 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  27.66 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  29.36 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  31.91 
 
 
124 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  30.15 
 
 
295 aa  47.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  49.06 
 
 
128 aa  47.8  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  25.93 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  28.37 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.92 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  42.86 
 
 
130 aa  47.4  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 
250 aa  47.4  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
172 aa  47.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  27.82 
 
 
276 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  40.3 
 
 
280 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.82 
 
 
150 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  27.62 
 
 
286 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
131 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.37 
 
 
153 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  27.97 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  42.22 
 
 
161 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 
145 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.37 
 
 
153 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  38.6 
 
 
133 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  42 
 
 
133 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  38.36 
 
 
147 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.35 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  35.38 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  43.14 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.65 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  29.86 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  30.99 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  28.89 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>