142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0324 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  100 
 
 		 138 aa  268  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  44.2 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  42.03 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  39.72 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  43.38 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  43.85 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  41.79 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  46.62 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  40.77 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  36.84 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  36.64 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  41.3 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  41.48 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  44.62 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  37.04 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  54.69 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  36.23 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  38.24 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  35.94 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  32.84 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  39.22 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  49.02 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  48.21 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  33.58 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  35.07 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.36 
 
 		 150 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  46.94 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  40 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  32.29 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  36.26 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  46.3 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  39.34 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  39.34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  25.47 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  39.39 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.62 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.85 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  37.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1012  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  47.06 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  32.58 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  34.25 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  37.23 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  46.15 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.73 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  38.6 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  36.46 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  40.82 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.82 
 
 		 347 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  40.32 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  36.73 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  33.6 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  31.39 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  27.61 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  27.21 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  39.62 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  33.33 
 
 		 297 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  41.18 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.69 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  40 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.78 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  28.4 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  39.34 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  39.22 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  46.81 
 
 		 280 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  37.25 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  39.22 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  37.25 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 294 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  37.25 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  45.76 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  38.2 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  28.92 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  35.82 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  28.92 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  39.22 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.94 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  27.16 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>