More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1012 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1012  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  25.16 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.92 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.32 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  25.66 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.03 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  26.28 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.39 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  27.63 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.85 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.03 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  25.48 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.67 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  25.97 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.67 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  28.29 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.03 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.7 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.07 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.95 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  25.16 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.48 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.1 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  29.45 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  30.32 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  23.08 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  27.63 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  27.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.67 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  22.82 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  26.62 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  25.32 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  28.95 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.48 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  22.73 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25.5 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  29.22 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  27.45 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  25.16 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.03 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  23.72 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  23.72 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.13 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  23.68 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  28.57 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  26.97 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  24.84 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  26.32 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.39 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.22 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  27.22 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  27.45 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  31.82 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  28.57 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  28.67 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.92 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  30.72 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  25.49 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25.97 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  23.84 
 
 		 282 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.32 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.85 
 
 		 290 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  28.21 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.27 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>