289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0593 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  100 
 
 
130 aa  259  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  90 
 
 
130 aa  215  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  61.24 
 
 
131 aa  150  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  53.08 
 
 
133 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  51.94 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  51.56 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  53.49 
 
 
134 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  48.06 
 
 
131 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  51.59 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  51.59 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  50.79 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  49.21 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.22 
 
 
129 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  47.69 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  46.51 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  46.51 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  42.19 
 
 
133 aa  104  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  49.24 
 
 
133 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  46.09 
 
 
130 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  39.84 
 
 
137 aa  95.9  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  48.84 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  53.08 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  42.22 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  41.86 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  42.03 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  37.12 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  36.36 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  38.17 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  38.28 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  38.69 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  33.86 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  33.59 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  52.73 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  35.11 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  38.16 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  36.72 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  37.5 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  48.98 
 
 
221 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  33.64 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30.28 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  36.36 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  44.78 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.55 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  39.74 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  29.23 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  37.18 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  36.9 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  32.1 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  47.92 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.71 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  48.15 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1012  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  47.92 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  51.06 
 
 
282 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  40.28 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  35.43 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  44.83 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
293 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  43.64 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  38.81 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  40.51 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  51.06 
 
 
280 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  28.41 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.13 
 
 
415 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  40.38 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  28.41 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
289 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  40.85 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
290 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  39.34 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  43.64 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  32.63 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  38.78 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.53 
 
 
208 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  42.59 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.35 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  44.64 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  40 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.43 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  36.78 
 
 
146 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
162 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  28.36 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.07 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  40 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  31.94 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25.58 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>